MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni M1 chromosome

Total Repeats: 35369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017280	A	7	7	30	36	100 %	0 %	0 %	0 %	384440682
2	NC_017280	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	384440682
3	NC_017280	ACAA	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	384440682
4	NC_017280	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	384440682
5	NC_017280	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440682
6	NC_017280	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440682
7	NC_017280	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	384440682
8	NC_017280	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	384440682
9	NC_017280	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440682
10	NC_017280	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440682
11	NC_017280	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440682
12	NC_017280	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440682
13	NC_017280	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	384440682
14	NC_017280	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440682
15	NC_017280	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440682
16	NC_017280	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440682
17	NC_017280	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440682
18	NC_017280	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	384440682
19	NC_017280	A	7	7	1099	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	384440682
20	NC_017280	CTAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	25 %	25 %	384440682
21	NC_017280	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440682
22	NC_017280	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	384440682
23	NC_017280	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	384440682
24	NC_017280	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440682
25	NC_017280	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440682
26	NC_017280	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	384440683
27	NC_017280	A	8	8	1547	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	384440683
28	NC_017280	T	8	8	1580	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	384440683
29	NC_017280	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440683
30	NC_017280	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440683
31	NC_017280	A	8	8	1653	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	384440683
32	NC_017280	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384440683
33	NC_017280	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440683
34	NC_017280	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440683
35	NC_017280	GTT	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440683
36	NC_017280	T	6	6	1764	1769	0 %	100 %	0 %	0 %	384440683
37	NC_017280	A	6	6	1781	1786	100 %	0 %	0 %	0 %	384440683
38	NC_017280	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	384440683
39	NC_017280	ACAA	2	8	1921	1928	75 %	0 %	0 %	25 %	384440683
40	NC_017280	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440683
41	NC_017280	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384440683
42	NC_017280	A	6	6	2065	2070	100 %	0 %	0 %	0 %	384440683
43	NC_017280	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440683
44	NC_017280	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	384440683
45	NC_017280	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	384440683
46	NC_017280	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	384440683
47	NC_017280	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	384440683
48	NC_017280	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440683
49	NC_017280	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440683
50	NC_017280	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440683
51	NC_017280	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440683
52	NC_017280	GTAT	2	8	2649	2656	25 %	50 %	25 %	0 %	384440684
53	NC_017280	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440684
54	NC_017280	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440684
55	NC_017280	GAAG	2	8	2771	2778	50 %	0 %	50 %	0 %	384440684
56	NC_017280	TAGT	2	8	2784	2791	25 %	50 %	25 %	0 %	384440684
57	NC_017280	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440684
58	NC_017280	CT	3	6	2951	2956	0 %	50 %	0 %	50 %	384440684
59	NC_017280	A	6	6	2957	2962	100 %	0 %	0 %	0 %	384440684
60	NC_017280	GAAA	2	8	2978	2985	75 %	0 %	25 %	0 %	384440684
61	NC_017280	A	7	7	3056	3062	100 %	0 %	0 %	0 %	384440684
62	NC_017280	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440684
63	NC_017280	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440684
64	NC_017280	TAAA	2	8	3258	3265	75 %	25 %	0 %	0 %	384440684
65	NC_017280	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	384440684
66	NC_017280	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
67	NC_017280	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	384440684
68	NC_017280	CT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	0 %	50 %	384440684
69	NC_017280	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440684
70	NC_017280	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440684
71	NC_017280	AC	3	6	3404	3409	50 %	0 %	0 %	50 %	384440684
72	NC_017280	TA	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	384440684
73	NC_017280	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440684
74	NC_017280	TGT	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440684
75	NC_017280	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
76	NC_017280	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384440684
77	NC_017280	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440684
78	NC_017280	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	384440684
79	NC_017280	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	384440684
80	NC_017280	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384440684
81	NC_017280	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440684
82	NC_017280	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440684
83	NC_017280	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440684
84	NC_017280	ATGA	2	8	4115	4122	50 %	25 %	25 %	0 %	384440684
85	NC_017280	ATTT	2	8	4142	4149	25 %	75 %	0 %	0 %	384440684
86	NC_017280	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440684
87	NC_017280	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	384440684
88	NC_017280	ATTT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	384440684
89	NC_017280	GAAT	2	8	4272	4279	50 %	25 %	25 %	0 %	384440684
90	NC_017280	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440684
91	NC_017280	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
92	NC_017280	AATGAA	2	12	4478	4489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384440684
93	NC_017280	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
94	NC_017280	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
95	NC_017280	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
96	NC_017280	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	384440684
97	NC_017280	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440684
98	NC_017280	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
99	NC_017280	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440684
100	NC_017280	TTC	2	6	4910	4915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440685
101	NC_017280	GTTTT	2	10	4921	4930	0 %	80 %	20 %	0 %	384440685
102	NC_017280	TTC	3	9	4952	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440685
103	NC_017280	ATA	2	6	4980	4985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440685
104	NC_017280	T	6	6	5006	5011	0 %	100 %	0 %	0 %	384440685
105	NC_017280	CATC	2	8	5055	5062	25 %	25 %	0 %	50 %	384440685
106	NC_017280	GCT	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440685
107	NC_017280	TGCA	2	8	5091	5098	25 %	25 %	25 %	25 %	384440685
108	NC_017280	AATC	2	8	5169	5176	50 %	25 %	0 %	25 %	384440685
109	NC_017280	T	7	7	5246	5252	0 %	100 %	0 %	0 %	384440685
110	NC_017280	GCAT	2	8	5285	5292	25 %	25 %	25 %	25 %	384440686
111	NC_017280	AT	3	6	5298	5303	50 %	50 %	0 %	0 %	384440686
112	NC_017280	CCT	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440686
113	NC_017280	ATA	2	6	5378	5383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440686
114	NC_017280	TTG	2	6	5389	5394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440686
115	NC_017280	T	6	6	5546	5551	0 %	100 %	0 %	0 %	384440686
116	NC_017280	T	6	6	5692	5697	0 %	100 %	0 %	0 %	384440686
117	NC_017280	ACC	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440686
118	NC_017280	ACAA	2	8	5771	5778	75 %	0 %	0 %	25 %	384440686
119	NC_017280	CTC	2	6	5872	5877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440686
120	NC_017280	TTC	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440686
121	NC_017280	ATA	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440686
122	NC_017280	CAT	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440686
123	NC_017280	T	6	6	6117	6122	0 %	100 %	0 %	0 %	384440686
124	NC_017280	TCT	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440686
125	NC_017280	T	6	6	6143	6148	0 %	100 %	0 %	0 %	384440686
126	NC_017280	TCTT	2	8	6197	6204	0 %	75 %	0 %	25 %	384440686
127	NC_017280	TGG	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440686
128	NC_017280	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440686
129	NC_017280	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440686
130	NC_017280	GATA	2	8	6322	6329	50 %	25 %	25 %	0 %	384440686
131	NC_017280	T	6	6	6335	6340	0 %	100 %	0 %	0 %	384440686
132	NC_017280	A	6	6	6390	6395	100 %	0 %	0 %	0 %	384440686
133	NC_017280	T	6	6	6450	6455	0 %	100 %	0 %	0 %	384440686
134	NC_017280	TCT	2	6	6471	6476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440686
135	NC_017280	TTGTT	2	10	6483	6492	0 %	80 %	20 %	0 %	384440686
136	NC_017280	TACT	2	8	6713	6720	25 %	50 %	0 %	25 %	384440687
137	NC_017280	GTT	2	6	6739	6744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440687
138	NC_017280	TGA	2	6	6746	6751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440687
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140	NC_017280	TTG	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440687
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268	NC_017280	A	6	6	12638	12643	100 %	0 %	0 %	0 %	384440689
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